De Veroorzaker |
13-09-2011 17:44 |
Citaat:
Kitten schreef:
(Bericht 31923820)
Ik kan je tot zo ver ook volgen (ik denk dat dat voor een aantal andere lezers niet zal gelden). Toch vind ik het jammer dat in het onderzoek geen cijfers staan over de dekkingsgraad van deze SNP-clusters voor de bevolking, en ik kan met voorstellen dat je ook gecombineerde SNP-clusters krijgt van mensen die ouders uit 2 groepen krijgen.
|
http://www.sciencedirect.com/science...88754311001960
Tabel geeft volgens mij de gedeelde varianten aan, dus AFR heeft 574,940 gedeeld met LAT; dat zou inderdaad kunnen betekenen dat je iemand met EAS en AFR voorouders in twee groepen moet indelen.
Array | EUR | EAS | AFR | LAT | Mitochondrial | Y | X | Autosomal | 1-rep | EUR | 674,518 | 386,841 | 384,966 | 434,028 | 116 | 289 | 13,123 | 660,990 | 0 | EAS | | 712,950 | 303,850 | 314,794 | 83 | 158 | 13,385 | 699,324 | 65,473 | AFR | | | 893,631 | 574,940 | 98 | 234 | 26,264 | 867,035 | 429,451 | LAT | | | | 817,810 | 123 | 234 | 25,397 | 792,056 | 282,901 |
Also, we felt that a single array platform with up to 700,000 SNPs universally applied to individuals of all racial/ethnic backgrounds was not optimal, because it would provide less coverage of lower frequency variation overall. Hence, our compromise was to design race/ethnicity specific arrays, which could provide coverage of both common and rare variation in multiple racial/ethnic groups.
Citaat:
Hoewel ik het heel leuk vind dat je de bron erbij noemt, weet ik dus niet of ik het met je conclusie eens bent dat je (omdat je genetische markers kan vinden die verschillende bevolkingsgroepen splitsen) daarom ook zicht hebt op het bestaan van rassen. Je bewijst wel dat bepaalde markers veel voorkomen in bepaalde groepen.
|
In biology, races are distinct genetically divergent populations within the same species with relatively small morphological and genetic differences.
Eens met die definitie?
Citaat:
Ook is het een tweede vraag wat de genetische verschillen zeggen. Omdat we met genetica te maken hebben, en 'ras' een lagere orde taxonomische indeling is, wordt het heel lastig om aan te geven waar we de indeling moeten maken. Je geeft hier een bron waarin 700.000 markers worden gebruikt, terwijl dat aantal me erg laag lijkt (ik ben niet zo goed hierin hoor :bloos:). Ik weet bijvoorbeeld dat bij DNA barcoding een interspecific variation van een klein stukje DNA (dus niet het hele DNA) al ongeveer 7% moet zijn. Waarbij intraspecifieke variatie onder de 0,5% ligt. En barcoding wordt gedaan met een stuk zeer sterk geconserveerd DNA. Ik weet niet precies hoe veel baseparen we in totaal hebben, maar over een geheel genoom gezien, lijkt me 700.000 baseparen een erg klein aantal.
|
3.000.000.000 basen dus 700.000 is maar iets van 0,02%
Niet heel veel, maar ze zijn wel zo gekozen dat ze iets zeggen over welke voorouders je hebt en tot welke groep je behoort. Het kan zijn dat je tot twee groepen behoort, maar dat gaat maar voor 1 generatie op.
Voor de stille lezers:
http://nl.wikipedia.org/wiki/Haplotype
http://nl.wikipedia.org/wiki/Single_...e_polymorphism
|