Identificeren van bacteriën
 

Hallo allemaal

Weet hier iemand een goede website of iets dergelijks waar stappen staan beschreven om bacteriën te identificeren?

Dit zou ik graag willen doen als onderdeel van mijn PWS. Ik snap dat de soort identificeren misschien wat moeilijk is maar tot het geslacht moet toch kunnen?

Dus als iemand hier een goede website heeft of goede literatuur wat betreft het identificeren van bacteriën zou ik dat zeer op prijs stellen.

We hebben monsters genomen binnen school en op/in ons lichaam. We gaan ook een gramkleuring doen.

Thnx voor de snelle reactie.

Leuk idee! Hier nog een stukje over de gramkleuring: http://www.c2w.nl/gramkleuring-gaat-...p.408004.lynkx

En dit is een verschrikkelijk lelijke website, maar toch wel nuttig: http://www.bioplek.org/animaties/cel.../bacterie.html

En dit omdat het op facebook stond:
http://www.huffingtonpost.com/entry/...b02f6a900d3d57

Thnx ik ga het allemaal zsm bekijken.

We hebben nu al 5 verschillende kolonies geselecteerd op kleur en de manier van groeien (er is 1 kolonie die onregelmatig groeit).

Het probleem is dat we nog steeds geen onderzoeksvraag hebben.

We dachten misschien iets met pH te kunnen doen door filterpapiertjes met verschillende pH op elke kolonie te leggen en dan te kijken of ze dood gaan etc.

Alleen moeten we hiermee wel ergens naartoe gaan. Ons PWS is tot nu toe dus nog niet echt specifiek.

Nadat ik dit topic had geopend bedenk ik me misschien wel een goede onderzoeksvraag.

"Is het mogelijk een bacterie te determineren met de spullen die we op school hebben liggen?"

Ik hoor graag commentaar/kritiek hierop.

De simpelste vorm van determineren van bacterien is een gramkleuring doen en de meest onderscheidende is het hele beestje sequencen, maar het hangt af van wat je precies wilt weten welke het meest nuttig is.

Ik zou proberen je onderzoeksvraag wat algemener te maken, bijvoorbeeld in hoeverre kun je een bacterie onderscheiden met de spullen die we hebben, of hoeveel klassen kun je ermee onderscheiden.Of andersom, wat zijn de minimale middelen die je nodig hebt om een (in je dagelijkse omgeving voorkomende) bacterie te kunnen classificeren.

Bedankt voor je snelle reactie!

Dus is deze onderzoeksvraag diepgaand genoeg en haalbaar denk je?

"In hoeverre kun je een bacterie onderscheiden met de spullen die we hebben op school?"

Denk jij dat we dmv pH ook soorten kunnen onderscheiden of zal de pH bij de meeste soorten binnen een geslacht hetzelfde effect hebben?

PS: we kunnen 1000x vergroten met een lichtmicroscoop op school.

Wat is sequencen?
We weten zelf ook niet wat we willen weten. Wat bedoel je met ''welke het meest nuttig is''?

Sequencen is de volgorde van de basen in het DNA bepalen en als je die dan vergelijkt met die van bekende soorten dan weet je precies met welke soort je te maken hebt (tenzij je een nieuwe soort ontdekt natuurlijk).

Met meest nuttig bedoel ik dat je methode moet passen bij wat je wilt weten, als je precies wilt weten welke bacterie het is dan is sequencn erg nuttig. Als je alleen wilt weten of een bacterie schadelijk is voor mensen of niet dan kom je met een gramkleuring een heel eind.

pH heeft wel invloed, maar vooral op de groeisnelheid. Je moet erg extreme pH's gebruiken om een bacterie dood te maken, maar je kunt wel zien of ze sneller of trager groeien bij een hoge of lage pH. Temperatuur heeft daar ook invloed op, in de koelkast groeien (delen) ze wel maar langzamer dan bij kamertemperatuur en bij de optimale temperatuur verdubbelt de heoveelheid elke 20 minuten dacht ik.
http://www.microbiologie.info/Temper...smiddelen.html

De deeltijd van bacteriën is wel verschillend per soort. Dus de ene kolonie zal in een broedstoof binnen 20 minuten verdubbelen, de andere binnen 4 uur.

Ik denk niet dat wij kunnen sequencen op school omdat je voor DNA-onderzoek geavanceerde apparatuur nodig hebt, toch?

Het lijkt me een goed plan om ons PWS richting het identificeren van bacteriën te brengen. Dus iets in de trant van ''In hoeverre kunnen wij bacteriën die voorkomen op school identificeren met de middelen die we hebben?''

Thanks. Misschien gaan we nog wat met de pH doen, morgen gaan we vragen aan onze begeleider of we een gramkleuring kunnen doen en of we kunnen testen op de enzymen katalase en oxidase.

Is het een handige methode om dmv het testen op verschillende enzymen zo onderscheid te maken tussen bacteriën?

Hiermee doel ik op aëroob of anaëroob, katalasepositief of katalasenegatief, grampositief of gramnegatief, wel of geen melkzuurbacterie.

Kunnen wij door zo te puzzelen, en het uiterlijk te bekijken met een lichtmicroscoop die 1000x kan vergroten, in ieder geval tot het geslacht komen?

http://www.microbiologie.info/enzyme...ntificatie.htm

Dat ligt een beetje aan welke bacterien je hebt, maar stafylokokken moet je er zo bijvoorbeeld wel uit kunnen halen.

Moet dat echt?

Nee we hebben een gesprek gehad. We zijn een andere weg nu ingeslagen. Wel nog steeds met bacteriën

Durian, misschien kan je De Veroorzaker interviewen voor je PWS? Bacterie-expert uit de praktijk opvoeren dit dat :cool:

Haha dat is wel een leuk idee